В том случае идет речь о здании, то употребление этих слов практически идиентично правомерно и верно. Просто необходимо знать, что храм — это место отправления культа, выполнения религиозных обрядов независимо от самого культа, а церковь — это храм в христианстве (так же как и мечеть в магометанстве, синагога в иудаизме и т.д.), т.е. храм — это более общее понятие, а церковь — применимое к христианству.
Так же понятие «церковь» обозначает организованное общество людей, соединенных единством вероучения, т.е. собрание верующих с общими религиозными устремлениями.